结构基因组学的主要任务是（结构基因）

真核生物结构基因，由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成，去除非编码区再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质，这些基因称为断裂基因（splite gene）。

在遗传学上通常将能编码蛋白质的基因称为结构基因。

真核生物的结构基因是断裂的基因。

一个断裂基因能够含有若干段编码序列，这些可以编码的序列称为外显子。

在两个外显子之间被一段不编码的间隔序列隔开，这些间隔序列称为内含子。

每个断裂基因在第一个和最后一个外显子的外侧各有一段非编码区，有人称其为侧翼序列。

在侧翼序列上有一系列调控序列。